洗涤塔为气液逆向接触的填料吸收塔。含硫沼气从洗涤塔底部进入与从塔顶进入的碱性循环水(贫液)在洗涤塔填料表面充分接触，硫化氢等硫化物与碱液发生化学反应，从而达到脱硫的目的，脱硫效果达到99%以上。反应后的循环水(富液)经洗涤塔底部进入到再生反应器。富液中的含硫化合物在再生反应器中经脱硫菌和氧气的作用下转变为单质硫，完成贫液再生。再生反应器产生的单质硫混浊液进入沉淀器沉淀，最终通过定期排放排出生物脱硫系统进行回收利用。